1、发生于生物体的不同部位
转录发生于一切活细胞，而复制仅仅发生于正处在分裂间期的细胞，比如，植物根尖的分生区细胞、人体皮肤的生发层细胞等。
2、发生于不同的时间
转录发生于细胞的整个生命周期中，贯穿于细胞的出生、生长、衰老、死亡，而复制仅发生于细胞分裂的间期。
3、后续阶段不同 转录的后续阶段是发生在核糖体上的翻译，而复制的后续阶段是细胞分裂。
4、发生的主体完整性不同
在某一段时间，一个细胞内，并不是全套基因都要转录，而只是发生在某些或某个基因中，而复制时，细胞内全部的DNA都要复制，包括线粒体DNA和叶绿体DNA。
5、作用的对象不同
转录仅仅发生在某个（些）基因内部的编码区，而复制则发生于细胞内全部DNA的全部长度范围内，包括端粒和着丝粒的复制
6、需要的酶不同
一般来说，转录需要DNA解旋酶、RNA聚合酶等，而复制则需要DNA解旋酶、DNA聚合酶、DNA连接酶（一条子链合成时需要）等。
7、需要的原料不同
转录需要四种核糖核苷酸，而复制则需要四种脱氧核苷酸。
8、需要的模板条数不同
转录需要某一条DNA链做模板，而复制则需要两条DNA链同时做模板。
9、研究时所作的放射性标记不同
研究转录时标记“尿嘧啶核糖核苷酸”，而研究复制时则标记“胸腺嘧啶脱氧核苷酸”。
10、起点和终点不同
转录是从DNA到RNA，包括mRNA、tRNA、rRNA，其中mRNA上有密码子，复制是从DNA到DNA，DNA携带着遗传信息。
