新风系统可以24小时不间断的持续工作，不管是室内的甲醛、笨、甲苯、二甲苯、氡气均可以排除室外。空气净化器即过滤室内污浊物，起到室内空气净化的效果，把室内空气中烟雾、颗粒物、粉尘净化掉，对雾霾的作用并不大，遇到雾霾严重天，基本一个月左右时间就得清洗一次滤网。
从净化面积的角度上来说，新风系统会比空气净化器更胜一筹。在面积比较大的室内想通过空气净化器来净化，除了多放置几台机器之外，根本达不到理想的净化效果。然而新风系统却不一样，虽然体积小巧，但功能高度集成，不仅能给室内空气带来净化的同时，还能通风换气、补充氧气。净化面积不再受控制，让你呼吸的每一口空气都清新自在。
节能性不同，新风系统中的全热交换功能最为突出，它能够在换气的同时把排出的污浊空气的能量储存下来，经过过滤重新转移到室内干净的空气中，从而使室内气温维持在恒定的水平中，而空气净化器是不具备这个功能的。
