1、神经系统危害由神经系统症状者占20%～50%。表现为自主神经系统功能紊乱，精神紧张，失眠多梦，健忘等。从病史中多见精神创伤引起发病或使病情加重的病例。
2、糖尿病国外学者反响口腔扁平苔藓病人中13%同时患有糖尿病。我国资料显示患糖尿病的不超过5%，但临床上往往见到当血糖及尿糖增多时口腔或皮肤的病情加重。反之，当血糖得到控制后口腔及皮肤的损害多会减轻或愈合。
3、其他全身疾病如心脏病、关节炎、泌尿系统疾病、女性月经不调、过敏、贫血等均有伴发，各在5%～10%。总之口腔扁平苔藓病人不伴发全身疾病仅在少数，低于10%。国内学者报道65例口腔扁平苔藓病人中有全身系统病163项，平均每人2～7种，少者1人1种，多的1人有9种全身病。只有5例无全身系统疾病。
