1、肝癌：甲胎蛋白在肝癌出现症状之前的8个月就已经升高,此时大多数肝癌病人仍无明显症状,肿瘤也较小,这部分患者经过手术治疗后,预后可得到明显改善,故肝硬化、慢性肝炎病人、家族中有肝癌患者的人应半年检测一次。
2、细胞肿瘤：患有生殖细胞肿瘤的患者大约50%的甲胎蛋白(AFP)都呈阳性。男性还要考虑睾丸癌。但也应该大于25μg/L,才有可能。
3、新生儿肝炎：30%新生儿肝炎可测出甲胎蛋白，发生率随病情的严重度而增加，大多明显增高。此可与先天性胆管闭锁相鉴别，后者甲胎蛋白大多正常。
4、其他因素：充血性肝肿大、共济失调、毛细血管扩张症、先天性酪氨酸病，孕妇（3-6个月）、睾丸或卵巢胚胎性肿瘤等。
