1、由于有功能的子宫内膜出现在了不该出现的位置，才会引起各种症状。月经的发生是由于体内激素波动引起的，因此，内异症的症状也和体内激素相关，是一种激素依赖性的疾病。常见的症状有痛经、慢性盆腔痛、性交痛、月经异常和不孕，也有25%的患者可能无任何症状。
2、 • 痛经和慢性盆腔痛：子宫内膜异位症最典型的症状为继发性痛经（以前不痛经，从某一次月经开始就会痛经），并且进行性加重。疼痛部位为下腹深部和腰部，可向会阴、肛门、大腿放射，部分患者有直肠刺激症状，表现为拉稀便和大便次数增多。
3、 • 性交痛：约30%的患者有此症状，比较典型的情况是：月经来潮前性交疼痛以及深部性交痛。 • 月经异常：约15%～30%的患者有经量增多、经期延长、月经淋漓不尽或经前点滴出血。
4、 • 不孕：有40%的内异症患者有不孕情况，而不孕的患者中，有80%存在内异症。 • 急腹痛：卵巢内异囊肿经常会出现小的破裂，破裂后立即被周围组织粘连造成一过性的下腹部或盆腔深部疼痛。
5、 • 其他症状：异位的子宫内膜是有生长功能的。因此在盆腔外组织有异位内膜种植和生长时，会出现结节样肿块，伴有周期性疼痛、出血和经期肿块明显增大，月经后缩小。比如肠道有异位内膜可出现腹痛、腹泻甚至周期性少量便血。膀胱有异位内膜可有经期尿痛、尿频和血尿。这些异位出血的时间一般都跟月经时间重合，这一特征也有助于子宫内膜异位症的诊断。
