1、10x单细胞ATAC-seq实验流程
首先，将转座酶加入制备好的单细胞核悬液进行反应。
随后，利用8通道的微流体双十字交叉系统将含Barcode的Gel Beads、细胞核和酶的混合物、油三者结合形成GEMs。在GEMs中，凝胶珠溶解释放大量barcode序列，DNA延伸带上barcode序列，并进行线性扩增。
最后，进行illumina的文库构建。
2、10x单细胞ATAC-seq可以有哪些方向的应用
从具体分析内容来讲，单细胞ATAT测序：
● 可在单细胞水平揭示细胞核内染色质可接近性的差异；
● 可鉴定细胞类型特异的转录因子，深入研究转录调控网络；
● 可预测转录因子结合位点，推测染色质调控活性。
从生物学研究大方向分，单细胞ATAC测序：
● 可应用于干细胞或发育生物学的研究，绘制驱动细胞分化的调控网络；
● 适用于免疫学研究，可揭示T细胞激活、分化等过程的表观调控机制；
● 可挖掘用于肿瘤亚型鉴定的新型分子标记，研究肿瘤发生相关的重要通路；
● 可应用于神经科学，鉴定复杂的神经细胞亚型，探究神经相关疾病的分子机制。
