一、含义不同
1、协助就是从旁帮助，辅助。可以是别人协助自己，也可以是自己协助别人。在当今的发展阶段，还有电脑远程协助等词出现。
2、所谓协同，就是指协调两个或者两个以上的不同资源或者个体，协同一致地完成某一目标的过程或能力。而所有有助于协同的软件都可以称作是协同软件。
协同现象在宇宙间一切领域中都普遍存在，没有协同，人类就不能生存，生产就不能发展，社会就不能前进。
2、词语来源不同
协助一词出自明末小说家冯梦龙《东周列国志》第五回：只有宋国忌公子冯在郑，实心协助。 意思是：只有宋国因为怕他们前君主的儿子公子冯在郑国，所以才真心帮助郑国。
协同一词来自古希腊语, 或曰协和、同步、和谐、协调、协作、合作。
3、侧重点不同
协助强调一方或多方对主要的一方提供帮助、辅助，其作用有主次之分。
协同强调互相配合，双方或多方起到的作用无主次之分。
