光学显微镜下能够看到的细胞器有：线粒体、叶绿体、液泡、核仁等大小超过0.2微米的结构。
电子显微镜下能够看到的细胞器有：线粒体、叶绿体、高尔基体、内质网、中心体、溶酶体、液泡、核糖体、过氧化物酶体、微体、细菌质粒、线粒体，中心体，高尔基体，细胞壁上的纹孔等。
使用显微镜的注意事项
1、必须熟练掌握并严格执行使用规程，按照严格的流程和说明书来操作显微镜。
2、取送显微镜时一定要一手握住弯臂，另一手托住底座。显微镜不能倾斜，以免目镜从镜筒上端滑出。取送显微镜时要轻拿轻放。
3、观察时，不能随便移动显微镜的位置。
